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雙源CT檢查分為平掃、增強(qiáng)和血管類的檢查，它的副作用不大，雙源CT主要的副作用就是有輻射，這是它的弊端。如果是孕期或者備孕的患者不可以做射線類的檢查，因為射線容易引起胎兒畸形。另外，如果做雙源CT增強(qiáng)或者血管類的檢查，這兩種檢查方法都需要注射造影劑，造影劑有可能會引起不良反應(yīng)。它的主要不良反應(yīng)是過敏反應(yīng)，輕度的過敏反應(yīng)會出現(xiàn)面部潮紅、頭痛、惡心、嘔吐、輕度蕁麻疹，重度的過敏反應(yīng)會出現(xiàn)嚴(yán)重的喉頭水腫及昏迷、休克等。

另外，如果是腎臟功能不好的患者，注射造影劑有可能會加重對腎臟功能的損害，所以腎功能不全的患者需要慎做。