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橋本甲狀腺炎的病因尚未完全明確，一般認(rèn)為與以下幾個方面的因素有關(guān)：
第一、遺傳，橋本甲狀腺炎具有一定的遺傳傾向，并且有自身免疫性疾病的家族聚集現(xiàn)象。
第二、自身免疫，認(rèn)為橋本甲狀腺炎的發(fā)病與自身免疫出現(xiàn)問題有直接關(guān)系，橋本甲狀腺炎的特征是血中存在有大量甲狀腺相關(guān)抗體，比如甲狀腺過氧化物酶抗體、甲狀腺球蛋白抗體以及甲狀腺微粒體抗體等。
第三、感染，感染學(xué)說認(rèn)為橋本甲狀腺炎是因為病毒感染，造成了人體間接誘發(fā)了甲狀腺細(xì)胞的特殊表達(dá)，從而引發(fā)了抗原的產(chǎn)生，這樣造成了大量甲狀腺細(xì)胞的破壞。目前認(rèn)為橋本甲狀腺的發(fā)生可能是病毒與其代謝產(chǎn)物甲狀腺和自身免疫三者相互作用的結(jié)果，并非單一因素所決定。
第四、環(huán)境因素，誘發(fā)橋本甲狀腺炎的環(huán)境因素很多，例如某些個煤類中的污染物，可以引起接觸人群甲狀腺自身抗體明顯增高。還有就是化學(xué)毒物，長期接觸這些物質(zhì)可以造成甲狀腺疾病的發(fā)生，特別是橋本甲狀腺炎的發(fā)生。
第五、碘過量，越來越多的研究表明，過量碘可以刺激自身免疫過程，從而引起橋本甲狀腺炎。
第六、非碘藥物，某些藥物可以造成橋本甲狀腺炎，例如碳酸鋰、鋰制劑可以抑制甲狀腺激素的分泌，這樣長期的刺激，可以使甲狀腺自身抗體出現(xiàn)陽性，從而誘發(fā)橋本甲狀腺炎的發(fā)生。