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腸鏡能檢查出直腸和結腸的很多病變，比如直腸結腸炎、潰瘍型結直腸炎、直腸結腸息肉、直腸結腸癌，以及直腸、結腸的黏膜下病變，比如黏膜下的囊腫、間質瘤、血管瘤等等。
腸鏡是指將腸鏡設備通過肛門伸入到直腸、結腸，在直視的狀態(tài)下觀察直腸、結腸的黏膜病變，所以腸道黏膜出現(xiàn)炎癥性病變、潰瘍性病變、腫瘤性病變，都可以在腸鏡下直觀地判斷。同時對于腫瘤性病變，可以取組織病理活檢來進一步判斷其性質。
對于腸道的黏膜下的病變，腸鏡也可以進行初步的判斷。這時表現(xiàn)為局部的隆起性病變，可以大致判斷其位于黏膜下，然后進一步可以通過超聲腸鏡來判斷其深度、表觀和形態(tài)，對于痔瘡也可以通過腸鏡來進行判斷。